別の支払い方法から口座振替に変更できますか

はい。できます。

管理画面より行えます。通常の支払い方法変更と同様に申し込みー課金情報の編集より支払い方法を口座振替に変更を行ってください。

その後、振替口座 登録・変更URLが申し込みメニューに表示されるようになります。このURLをお客様に案内することで　口座を登録することができます。

デフォルトでは、マイページにてのクレジットカード払いからの支払い方法変更は出来ない設定です。