管理画面で継続課金２回目の請求が登録されていません。

Paypalの場合は、請求が登録されるタイミングが以下になります。

決済成功：入金通知（決済成功）で支払いが「受領」で登録されます。
決済エラー：管理画面では登録が行われません。

決済は5日毎に3回自動で行われます。
リトライ後決済エラーの場合は定期支払の失敗（断念）となります。

PayPalからの定期支払の失敗（断念）通知が来た際に顧客にロックがかかります。